Las primeras referencias de Villafeliche las tenemos en época árabe, cuando la localidad contaba con un castillo y una pequeña población a sus pies. Poco a poco, esta población va ganando importancia debido a la abundancia de recursos naturales que tenía a sus alrededores: agua y materiales. El asentamiento de los árabes en el territorio durante casi cinco siglos dejará huella y una influencia en la manera de vivir que aún hoy en día heredamos.
La historia de Villafeliche cambió el 17 de junio de 1120, tras la derrota almorávide en la batalla de Cutanda (a 50 km de Villafeliche) a manos de Alfonso I de Aragón, el Batallador, quien por cierto había participado como infante en la expedición de 1097 a Valencia para ayudar al Cid contra los almorávides.
Tras Cutanda los aragoneses ocuparon las ciudades de Daroca y Calatayud, y el valle del Jiloca hasta Monreal del Campo.
Si bien muchos de los conquistados abandonaron entonces sus hogares, en Villafeliche permaneció una importante población musulmana. A partir del siglo XIII la villa quedó vinculada a los Azagra, familia ligada a Albarracín.
El fin de la población musulmana tendría lugar en 1610, con la expulsión general de los moriscos: entonces debieron abandonar Villafeliche unos 1.700, ocho veces su población actual.